Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEBLO76041 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEBLO76041 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEBLO76041 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEBLO76041 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEBLO76041 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEBLO76041 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEBLO76041 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEBLO76041 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEBLO76041 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEBLO76041 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEBLO76041 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEBLO76041 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEBLO76041 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms