Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BANF1O75531 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BANF1O75531 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BANF1O75531 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BANF1O75531 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BANF1O75531 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BANF1O75531 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BANF1O75531 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BANF1O75531 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BANF1O75531 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms