Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
ABCC9O60706 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
ABCC9O60706 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC9O60706 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC45.57■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms