Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPX2O60687 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPX2O60687 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms