Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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