Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN4O43707 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN4O43707 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms