Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRC1O43663 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRC1O43663 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRC1O43663 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRC1O43663 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRC1O43663 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRC1O43663 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRC1O43663 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRC1O43663 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRC1O43663 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRC1O43663 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRC1O43663 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRC1O43663 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRC1O43663 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRC1O43663 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRC1O43663 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRC1O43663 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRC1O43663 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRC1O43663 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRC1O43663 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms