Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSTPIP1O43586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSTPIP1O43586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSTPIP1O43586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms