Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DENRO43583 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DENRO43583 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DENRO43583 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DENRO43583 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DENRO43583 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DENRO43583 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DENRO43583 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DENRO43583 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DENRO43583 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DENRO43583 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DENRO43583 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DENRO43583 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DENRO43583 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DENRO43583 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DENRO43583 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DENRO43583 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DENRO43583 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms