Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF13O43567 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF13O43567 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF13O43567 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF13O43567 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF13O43567 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF13O43567 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF13O43567 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF13O43567 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF13O43567 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF13O43567 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF13O43567 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF13O43567 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms