Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGOLN2O43493 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGOLN2O43493 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms