Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COCHO43405 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COCHO43405 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COCHO43405 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COCHO43405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COCHO43405 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COCHO43405 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COCHO43405 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COCHO43405 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COCHO43405 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COCHO43405 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COCHO43405 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COCHO43405 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COCHO43405 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COCHO43405 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COCHO43405 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.9 ms