Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SART1O43290 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SART1O43290 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SART1O43290 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SART1O43290 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SART1O43290 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SART1O43290 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SART1O43290 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SART1O43290 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SART1O43290 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SART1O43290 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SART1O43290 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SART1O43290 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SART1O43290 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms