Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD3O43242 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD3O43242 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD3O43242 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms