Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP26A1O43174 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP26A1O43174 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms