Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01565O15544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms