Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBDO15205 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBDO15205 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBDO15205 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBDO15205 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBDO15205 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBDO15205 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBDO15205 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBDO15205 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBDO15205 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBDO15205 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBDO15205 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBDO15205 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms