Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIPC1O14908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms