Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN9O14815 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms