Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDC80O14777 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDC80O14777 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDC80O14777 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDC80O14777 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDC80O14777 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDC80O14777 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms