Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHE40O14503 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHE40O14503 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms