Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F3O00716 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F3O00716 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F3O00716 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F3O00716 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F3O00716 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F3O00716 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F3O00716 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F3O00716 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F3O00716 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F3O00716 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F3O00716 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F3O00716 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F3O00716 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F3O00716 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F3O00716 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms