Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOP56O00567 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP56O00567 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP56O00567 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOP56O00567 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP56O00567 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP56O00567 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP56O00567 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP56O00567 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms