Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBAG9O00559 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBAG9O00559 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms