Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3FO00303 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3FO00303 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3FO00303 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms