Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIEO00221 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIEO00221 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms