Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QQQ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QQQ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QQQ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QQQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QQQ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QQQ9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QQQ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QQQ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms