Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1W4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1W4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1W4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1W4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1W4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1W4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1W4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1W4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1W4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1W4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
H7C1W4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
H7C1W4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1W4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1W4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1W4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1W4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1W4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1W4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1W4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1W4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1W4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1W4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1W4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1W4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms