Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA8SH3BPF8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA8SH3BPF8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms