Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB6E9PJ23 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms