Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
B4DXG7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
B4DXG7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
B4DXG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
B4DXG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
B4DXG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
B4DXG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
B4DXG7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
B4DXG7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
B4DXG7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
B4DXG7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms