Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM1B2RUZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms