Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MVJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MVJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A8MVJ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms