Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms