Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8L1PA6NM43 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8L1PA6NM43 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms