Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85CA6NKD9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85CA6NKD9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms