Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN8A6NHC0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN8A6NHC0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms