Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GMNCA6NCL1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms