Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC13A5PLN9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms