Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC01553A4QN01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms