Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD3A2A2Y4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD3A2A2Y4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms