Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE3A1L190 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms