Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYJ7

TRAV8-3, T-cell receptor alpha variable 8-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms