Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087X0T9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087X0T9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.9 ms