Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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