Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMUB2Q71RG4 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms