Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SNHG15-209ENST00000584686 541 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM208BQ5VWN6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms