Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KLHL22Q53GT1 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms