Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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