Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms